Нападение мутантов

После вторжения, организованного агентом Бишопом, генетический материал реплицированных пришельцев соединяется с обитателями канализации и окружающих водных путей, вызывая вспышку мутантов. Опасаясь распространения эпидемии, Бишоп посылает Бакстера Стокмана сдержать угрозу. Тем временем черепахи ищут предметы для обустройства своего нового логова, но теперь должны столкнуться с угрозой нападения мутантов, во время которого один из них задел Дона.